横跨2022和2023年两个夏天,2024届分子生物学专业本科生Semin Kim和她的队友,在昆山的九家动物诊所,采集了200份猫的鼻咽拭子样本,并绘制了昆山首个猫杯状病毒的分子流行病学和分子特征的报告。他们的研究成果日前发表于BMC Virology Journal上。
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猫杯状病毒(Feline calicivirus ,FCV)是一种传染性极强的猫病毒,通常会引起猫呼吸道和口腔的感染。尽管国内养宠人士已普遍为猫常规接种FCV疫苗,但新发病例仍时有发生,新的变异株的出现也降低了传统疫苗的保护效果。在该研究之前,还从未有人对昆山本地的猫感染的FCV病毒毒株做过遗传和系统发育分析。
在采集的200 份样本中,FCV病毒检测率为26%,其流行率高于之前在中国进行的其他研究。在FCV阳性猫中,32.7%接种过疫苗,接种过疫苗的猫一般临床症状较轻。感染FCV和猫的品种无关,感染的毒株中,71.15%为基因型II。研究也观察到部分毒株存在新的突变,这些突变可能会增强病毒的适应能力,影响和降低现有常规猫疫苗的效果。
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“新冠的大流行激发了我对生物学的浓厚兴趣,我在2021年加入了Benjamin Anderson博士和Sajid Umar博士共同领导的全健康实验室,并开始着手研究那些与人类共同生活的动物,了解它们易感染的疾病的分子流行病学特征,”Semin Kim说。
该项目在2022年也获得了昆山杜克大学“大创”创新训练计划的资金支持,Semin作为项目的主要负责人,从项目资金申请方案的撰写到合作者联系、样本采集、实验室分析到论文撰写,她作为项目的负责人始终领导、跟进和参与每一个环节。
“尽管我作为一名本科生,可能并没有太多经验,但能够有机会完整地领导这样的研究项目,对我来说是非常宝贵的经历。最重要的是,我理解了沟通能力是推动科研工作的关键,它可以帮助我们与队友、导师、当地合作方、论文合著者,以及审稿人建立更好的联系,高效推动项目并实现项目目标,”Semin说。
项目组另外两名成员——2024届分子生物学专业本科生程懿希、2024届全球健康专业本科生方镇堃,也共同参与了该项目的合作方协调、沟通以及实验室工作。
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“最辛苦的是与昆山当地的宠物诊所建立合作关系,”程懿希回顾项目经历,她认为最挑战的是回答合作方各种刁钻的问题,取得宠物诊所的信任,还要学会适应那些“偶尔的拒绝”,而这些经历也给她带来收获与成长。
程懿希还参与了大量的实验室工作。“我很高兴能将实验室学到的知识应用于实践,而且这是和我们生活息息相关的研究。现在爱猫和养猫的人越来越多,守护动物的健康其实也是守护人类自己的健康,这也是全健康研究的核心理念,” 程懿希说。
研究经历对于方镇堃而言是一段“愉快的回忆”。他是项目的另外一名牵头人,既要参与资金申请的文书工作,又要负责样本的采集和在实验室中提取样本中病毒的RNA,做PCR实验分析病毒的基因型。“这个过程非常磨练人,我需要非常小心,因为样本是很宝贵的,如果操作不当,我们最终分析的数据的质量也会受到很大的影响。”
“三位同学在项目推动、参与样本收集、社区合作方谈判、实验室样本处理和后续分析的过程中展现了高度的自主性和非常优秀的团队合作精神,”项目指导老师、昆山杜克大学全球健康助理教授、全健康研究实验室副主任Sajid Umar表示。“全健康致力于通过跨学科、跨地区的协作,促进人和动物的健康,维护并改善我们生活的环境,它已成为全球健康领域越来越重要的一种研究和实践的方法,用以应对抗生素耐药、人畜共患病、病媒传播疾病、食品安全以及环境健康方面的一系列问题。”
*阅读论文原文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38414028/ *了解昆山杜克大学全健康实验室:https://sites.duke.edu/dkuonehealth/